أن تكون مدرسة العلوم الأساسية مركزا إقليمياً وعلمياً متميزاً في بناء المعرفة العلمية، ونموذجاً رائداً في التكامل بين العلوم الأساسية والتقنية لابتكار حلول مستدامة تخدم البشيرة وتواكب التطور العلمي.

تسعي مدرسة العلوم الأساسية الى تقديم برامج اكاديمية متميزة تلبي معايير الجودة العالمية، لتأهيل خريجين مزودين بالمهارات العلمية والبحثية والتقنية في مجالات تخصصاتهم، كما تلتزم المدرسة بالمساهمة في اثراء البحث العلمي الابتكاري، وتقديم الحلول والاستشارات العلمية الفعالة لمواجهة التحديات المحلية والإقليمية والعالمية المتعلقة بالتقنية وعلوم الأرض وعلوم الحياة، في إطار من القيم المهنية والأخلاقية، مع تعزيز قيم البحث العلمي المستدام. 

لدي المدرسة العديد من الأهداف نبرز أهمها: -

• الحصول على الاعتمادات الاكاديمية المحلية والدولية لكل البرامج الدراسية.
• إنشاء مختبرات علمية وتقنية داخل الاكاديمية في مجالات تخصصات المدرسة.
• تحديث الخطط الدراسية بانتظام لدمج أحدث الاكتشافات العلمية والتقنيات البرمجية.
• تبني استراتيجيات تعلم حديثة تعتمد على التفكير النقدي والتدريب المختبري والميداني.
• اجراء ورش العمل والندوات والمؤتمرات لرفع كفاءة الطلاب وأعضاء هيئة التدريس.
• تشجيع البحوث البينية التي تجمع بين التخصصات الثلاثة (علوم الحياة، علوم الحاسوب، علوم الأرض).
• التميز في البحث العلمي من خلال إجراء أبحاث الهندسة الوراثية والبيولوجيا الجزئية، دمج الهندسة مع علم الاحياء لإنتاج ادوية أو لقاحات أو أنظمة توصيل دواء دقيقة، والذكاء الاصطناعي والحوسبة فائقة الأداء والتعاون البحثي مع كليات الطب، استخدام الأقمار الصناعية والوسائط الحديثة لرسم الخرائط الجيولوجية ومراقبة التغيرات القشرية...الخ.
• دعم النشر العلمي في المجلات العلمية المحكمة ذات التأثير العالي لرفه تصنيف المؤسسة أكاديمياً.
• تقديم الخبرات والاستشارات والحلول التقنية والبيئية للمجتمع المحلي والمؤسسات المحلية والعالمية.